Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR4O95473 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR4O95473 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms