Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAPGEF3O95398 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
RAPGEF3O95398 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
RAPGEF3O95398 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RAPGEF3O95398 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms