Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCB11O95342 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCB11O95342 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB11O95342 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms