Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNCGO76070 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCGO76070 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCGO76070 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCGO76070 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCGO76070 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCGO76070 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNCGO76070 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNCGO76070 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCGO76070 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCGO76070 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCGO76070 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNCGO76070 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNCGO76070 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNCGO76070 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNCGO76070 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNCGO76070 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNCGO76070 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNCGO76070 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNCGO76070 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNCGO76070 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNCGO76070 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNCGO76070 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNCGO76070 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNCGO76070 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNCGO76070 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNCGO76070 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNCGO76070 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNCGO76070 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNCGO76070 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNCGO76070 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms