Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT34O76011 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT34O76011 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT34O76011 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT34O76011 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT34O76011 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT34O76011 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT34O76011 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT34O76011 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT34O76011 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT34O76011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT34O76011 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT34O76011 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT34O76011 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT34O76011 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT34O76011 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT34O76011 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT34O76011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT34O76011 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT34O76011 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT34O76011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT34O76011 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT34O76011 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT34O76011 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT34O76011 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT34O76011 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT34O76011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT34O76011 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT34O76011 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT34O76011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT34O76011 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT34O76011 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT34O76011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT34O76011 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT34O76011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT34O76011 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT34O76011 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT34O76011 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT34O76011 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT34O76011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT34O76011 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT34O76011 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT34O76011 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT34O76011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT34O76011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT34O76011 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT34O76011 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT34O76011 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms