Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD17O75943 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD17O75943 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD17O75943 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD17O75943 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD17O75943 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD17O75943 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD17O75943 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD17O75943 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD17O75943 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD17O75943 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD17O75943 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD17O75943 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD17O75943 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD17O75943 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD17O75943 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD17O75943 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD17O75943 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD17O75943 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD17O75943 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD17O75943 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD17O75943 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD17O75943 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAD17O75943 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD17O75943 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD17O75943 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD17O75943 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD17O75943 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD17O75943 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD17O75943 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD17O75943 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD17O75943 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD17O75943 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD17O75943 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD17O75943 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD17O75943 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD17O75943 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD17O75943 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD17O75943 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD17O75943 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD17O75943 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD17O75943 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD17O75943 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD17O75943 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD17O75943 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD17O75943 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD17O75943 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD17O75943 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD17O75943 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD17O75943 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD17O75943 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAD17O75943 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RAD17O75943 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAD17O75943 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RAD17O75943 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD17O75943 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD17O75943 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD17O75943 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD17O75943 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD17O75943 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD17O75943 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD17O75943 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD17O75943 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAD17O75943 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAD17O75943 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD17O75943 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD17O75943 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD17O75943 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD17O75943 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD17O75943 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD17O75943 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAD17O75943 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAD17O75943 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD17O75943 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD17O75943 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD17O75943 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD17O75943 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD17O75943 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD17O75943 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD17O75943 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD17O75943 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD17O75943 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD17O75943 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD17O75943 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD17O75943 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD17O75943 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD17O75943 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD17O75943 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD17O75943 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD17O75943 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD17O75943 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD17O75943 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD17O75943 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD17O75943 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD17O75943 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD17O75943 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD17O75943 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD17O75943 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD17O75943 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD17O75943 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms