Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VAMP4O75379 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VAMP4O75379 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
VAMP4O75379 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms