Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIA2O75334 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA2O75334 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA2O75334 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA2O75334 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA2O75334 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms