Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP12O75317 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP12O75317 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP12O75317 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP12O75317 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP12O75317 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP12O75317 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP12O75317 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP12O75317 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP12O75317 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP12O75317 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP12O75317 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP12O75317 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP12O75317 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP12O75317 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP12O75317 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP12O75317 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP12O75317 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP12O75317 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP12O75317 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP12O75317 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP12O75317 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP12O75317 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP12O75317 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP12O75317 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP12O75317 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP12O75317 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP12O75317 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP12O75317 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP12O75317 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP12O75317 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP12O75317 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP12O75317 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP12O75317 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP12O75317 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP12O75317 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP12O75317 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
USP12O75317 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP12O75317 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP12O75317 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP12O75317 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP12O75317 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP12O75317 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP12O75317 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP12O75317 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP12O75317 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP12O75317 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP12O75317 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP12O75317 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP12O75317 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP12O75317 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP12O75317 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP12O75317 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP12O75317 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP12O75317 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP12O75317 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP12O75317 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP12O75317 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP12O75317 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP12O75317 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP12O75317 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP12O75317 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP12O75317 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP12O75317 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP12O75317 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP12O75317 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP12O75317 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP12O75317 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP12O75317 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP12O75317 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP12O75317 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP12O75317 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP12O75317 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP12O75317 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP12O75317 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms