Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF2O60811 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF2O60811 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF2O60811 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms