Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR5O60602 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR5O60602 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR5O60602 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR5O60602 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR5O60602 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR5O60602 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR5O60602 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR5O60602 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR5O60602 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR5O60602 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR5O60602 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR5O60602 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR5O60602 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR5O60602 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR5O60602 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR5O60602 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR5O60602 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR5O60602 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR5O60602 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR5O60602 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR5O60602 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR5O60602 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLR5O60602 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR5O60602 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR5O60602 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR5O60602 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR5O60602 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR5O60602 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR5O60602 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR5O60602 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR5O60602 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR5O60602 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR5O60602 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR5O60602 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR5O60602 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR5O60602 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR5O60602 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR5O60602 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR5O60602 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR5O60602 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR5O60602 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR5O60602 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLR5O60602 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLR5O60602 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR5O60602 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR5O60602 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR5O60602 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR5O60602 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR5O60602 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR5O60602 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TLR5O60602 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLR5O60602 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLR5O60602 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR5O60602 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR5O60602 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR5O60602 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR5O60602 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR5O60602 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR5O60602 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms