Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD2O60548 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD2O60548 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD2O60548 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD2O60548 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms