Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
KIAA0556O60303 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
KIAA0556O60303 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KIAA0556O60303 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
KIAA0556O60303 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
KIAA0556O60303 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms