Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFDO43915 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VEGFDO43915 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms