Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BUD23O43709 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BUD23O43709 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BUD23O43709 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BUD23O43709 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BUD23O43709 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BUD23O43709 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BUD23O43709 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BUD23O43709 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BUD23O43709 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BUD23O43709 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BUD23O43709 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BUD23O43709 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BUD23O43709 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BUD23O43709 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BUD23O43709 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BUD23O43709 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BUD23O43709 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BUD23O43709 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BUD23O43709 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BUD23O43709 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BUD23O43709 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BUD23O43709 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BUD23O43709 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BUD23O43709 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BUD23O43709 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BUD23O43709 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BUD23O43709 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BUD23O43709 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BUD23O43709 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BUD23O43709 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BUD23O43709 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BUD23O43709 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BUD23O43709 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BUD23O43709 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BUD23O43709 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BUD23O43709 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BUD23O43709 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BUD23O43709 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BUD23O43709 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BUD23O43709 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BUD23O43709 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BUD23O43709 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BUD23O43709 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BUD23O43709 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BUD23O43709 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BUD23O43709 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BUD23O43709 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BUD23O43709 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BUD23O43709 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BUD23O43709 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BUD23O43709 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BUD23O43709 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BUD23O43709 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BUD23O43709 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BUD23O43709 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BUD23O43709 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BUD23O43709 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BUD23O43709 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BUD23O43709 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BUD23O43709 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BUD23O43709 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BUD23O43709 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BUD23O43709 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BUD23O43709 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BUD23O43709 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BUD23O43709 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BUD23O43709 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BUD23O43709 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BUD23O43709 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BUD23O43709 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BUD23O43709 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms