Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms