Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN4O43707 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN4O43707 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN4O43707 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms