Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCXO43602 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCXO43602 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCXO43602 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCXO43602 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCXO43602 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCXO43602 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCXO43602 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCXO43602 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCXO43602 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCXO43602 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DCXO43602 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCXO43602 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCXO43602 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCXO43602 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DCXO43602 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCXO43602 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCXO43602 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCXO43602 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCXO43602 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DCXO43602 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DCXO43602 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCXO43602 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCXO43602 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCXO43602 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCXO43602 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCXO43602 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCXO43602 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCXO43602 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCXO43602 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCXO43602 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCXO43602 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCXO43602 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCXO43602 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCXO43602 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCXO43602 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCXO43602 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCXO43602 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCXO43602 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCXO43602 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCXO43602 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCXO43602 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCXO43602 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCXO43602 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCXO43602 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCXO43602 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCXO43602 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCXO43602 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCXO43602 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCXO43602 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCXO43602 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCXO43602 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCXO43602 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCXO43602 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCXO43602 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCXO43602 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCXO43602 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCXO43602 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCXO43602 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DCXO43602 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCXO43602 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DCXO43602 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCXO43602 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCXO43602 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCXO43602 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCXO43602 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCXO43602 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCXO43602 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCXO43602 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCXO43602 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCXO43602 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCXO43602 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCXO43602 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms