Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD3O43242 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD3O43242 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD3O43242 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms