Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DYNC1LI2O43237 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DYNC1LI2O43237 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DYNC1LI2O43237 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DYNC1LI2O43237 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DYNC1LI2O43237 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DYNC1LI2O43237 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DYNC1LI2O43237 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DYNC1LI2O43237 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DYNC1LI2O43237 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DYNC1LI2O43237 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms