Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SLC2A9-212ENST00000512342 967 ntTSL 37.13□□□□□ -1.275e-15■■■■■ 31
PRPF4O43172 SLC2A9-205ENST00000503803 644 ntTSL 36.65□□□□□ -1.345e-15■■■■■ 31
PRPF4O43172 PNCK-219ENST00000463548 783 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 31
PRPF4O43172 PNCK-212ENST00000434652 311 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 31
PRPF4O43172 AATK-AS1-202ENST00000571031 1488 ntTSL 1 (best)20.89■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 30.9
PRPF4O43172 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 220.77■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 30.9
PRPF4O43172 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 30.9
PRPF4O43172 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 49.32□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 30.9
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PRPF4O43172 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 30.9
PRPF4O43172 SYNGAP1-227ENST00000638142 2499 ntTSL 521.3■■□□□ 13e-9■■■■■ 30.9
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PRPF4O43172 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 30.9
PRPF4O43172 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 30.9
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PRPF4O43172 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 30.5
PRPF4O43172 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 30.5
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PRPF4O43172 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 313.66□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 30.5
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PRPF4O43172 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 30.5
PRPF4O43172 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -03e-8■■■■■ 30.5
PRPF4O43172 AGPAT1-207ENST00000476663 746 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 30.5
PRPF4O43172 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 30.5
PRPF4O43172 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 30.5
PRPF4O43172 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 210.32□□□□□ -0.763e-8■■■■■ 30.5
PRPF4O43172 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 30.4
PRPF4O43172 CLUH-209ENST00000574210 1243 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 30.4
PRPF4O43172 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 30.4
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PRPF4O43172 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 30.4
PRPF4O43172 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 30.4
PRPF4O43172 HNF1A-214ENST00000560968 3030 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 30.4
PRPF4O43172 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 30.4
PRPF4O43172 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 30.4
PRPF4O43172 SUMO1-208ENST00000409627 722 ntTSL 316.04■□□□□ 0.162e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-15■■■■■ 30.3
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