Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM9SF1O15321 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF1O15321 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF1O15321 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms