Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHOX2AO14813 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms