Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR3AO14802 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR3AO14802 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLR3AO14802 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLR3AO14802 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.82■■■■□ 3
POLR3AO14802 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.82■■■■□ 3
POLR3AO14802 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
POLR3AO14802 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
POLR3AO14802 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR3AO14802 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR3AO14802 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR3AO14802 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
POLR3AO14802 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLR3AO14802 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
POLR3AO14802 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
POLR3AO14802 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.79■■■■□ 3
POLR3AO14802 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLR3AO14802 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLR3AO14802 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLR3AO14802 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
POLR3AO14802 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.78■■■■□ 3
POLR3AO14802 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
POLR3AO14802 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLR3AO14802 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLR3AO14802 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
POLR3AO14802 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLR3AO14802 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms