Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITPNM1O00562 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM1O00562 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITPNM1O00562 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms