Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN5O00501 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN5O00501 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN5O00501 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms