Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1AO00322 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK1AO00322 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms