Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFXAPO00287 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms