Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BML4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BML4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BML4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BML4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BML4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BML4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BML4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BML4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BML4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BML4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BML4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BML4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BML4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BML4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BML4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BML4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BML4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BML4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BML4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BML4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BML4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BML4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BML4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BML4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BML4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BML4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BML4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BML4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BML4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BML4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BML4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BML4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BML4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BML4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BML4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BML4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BML4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BML4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BML4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BML4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BML4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BML4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BML4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms