Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVV-1B6SEH8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-1B6SEH8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-1B6SEH8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms