Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM1B2RUZ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms