Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYSRT1A8MQ03 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYSRT1A8MQ03 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYSRT1A8MQ03 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms