Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PP2D1A8MPX8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PP2D1A8MPX8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PP2D1A8MPX8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms