Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WIPF3A6NGB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms