Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP73A6NFT4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP73A6NFT4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP73A6NFT4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms