Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT1A5YKK6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT1A5YKK6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT1A5YKK6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms