Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPED1A4D0V7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPED1A4D0V7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms