Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO3A2RU48 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO3A2RU48 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO3A2RU48 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms