Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBASA2RRP1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBASA2RRP1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBASA2RRP1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms