Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBA6A0AVT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBA6A0AVT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UBA6A0AVT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms