Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV2A0A0J9YWF9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms