Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMBRD1Q9NUN5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms