Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP7BPQ9NSQ0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms