Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FKRPQ9H9S5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms