Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLIRPQ9GZT3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms