Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF6Q9BYE7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF6Q9BYE7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms