Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNPPD1Q9BV87 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms