Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS8Q99627 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 902.1 ms