Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SORT1Q99523 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms