Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC17Q96LX7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms