Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms